南仁山生態保護區位於墾丁國家公園東北方，屬於屏東縣滿州鄉境內，面積約5,800公頃，是一處天然熱帶季風雨林，也是國內少數的低海拔原始林。全區大體上以太平山、南仁山、萬里得山、出風山、滿州山、豬月勞束山間的主山脊線向東西兩面傾斜，坡度陡峻，兼備丘陵、山谷、沼潭、溪流、山坡、草原等變化多端之地形地勢。
由於位處偏僻交通不便罕見人跡，除南山路的窪地為管理處管所轄的南仁湖外，其餘地區均屬國有林班地，除小部份地區已遭濫墾或改植人造林外，多為濃密原始林所覆蓋，其間孕育上千種植物與各類野生動物，每年十月大批灰面鷲會在此過境，場面壯觀。南仁山有完整的動物相及珍貴植物群，學術研究價值極高，也是環境教育的珍貴區域。
南仁山生態保護區，以海拔526公尺的萬里得山為本區最高點，479公尺高的南仁山是次高點。每年10月至翌年3月之東北季風，對本區植物生態造成廣大影響。
迎風面的植被以殼斗科、茶科、冬青科和八角茴香科為主，樹型較低矮，屬於亞熱帶或溫帶常綠闊葉森林。這些植物在台灣中北部多分佈在海拔一千公尺處，而在南仁山區則僅在海拔五百公尺以下即出現，十分特殊。
區內有真菌類342種菌類，其中擔子菌300種，子囊菌42種；在背風溪谷區，則以茜草科、大戟科及桑科等植物為主，具有支柱根、板根、幹生花及木質藤本等近似熱帶雨林的特徵。根據調查發現，保護區內計有80種鳥類，24種蛇類，13種蜥蜴守宮，12種魚類，19種蛙類，11種哺乳類，5種龜鱉、16目77科416種昆蟲（其中鞘翅目117種、鱗翅目118種），而蝴蝶則有7科65種之多、溪蟹等，故以動物中種類而言，本區是墾丁國家公園精華所在。
保護區內的南仁湖是登山者最渴望進入的地域，南仁山屬低海拔的丘陵地，因缺少出水口，就形成小型的湖泊或沼澤，這就是著名的南仁湖，總面積約28公頃，不過南仁湖的景觀要視湖水多寡而定，水多時會形成小型的千島湖奇景。
南仁山保護區內也闢有環境教育步道，由南仁山管理站為起點，至南仁湖畔，單趟路程約為4.3公里，來回路程就得花費2.5到3小時左右，腳程不好的人走起力有點吃力。 （資料來源：交通部觀光局 http://travel.taiwan.net.tw/）